Second, we can consider "canonical" sequences only where we don't allow trivial redundancies like R R2 or L R L, and commuting moves are always in a specific order (as in U D but not D U). A recurrence formula gives the number of such 20-move canonical sequences to be 43946585901564160587264. This is enough to generate each position about 1016 times, but again the count for individual positions will vary. I think the number of times superflip would be generated by canonical sequences would be about 2*48*2*(20+3) = 4416. This is about 1 in 10 quintillion.
We would need to determine exactly the number of superflip maneuvers to get exact answers, but someone correct me if you think I've made any gross error in my estimates.
I used my Cube Explorer program to generate all essential different maneuvers for superflip. Cube Explorer reduces the search space by the symmetries of the position, but not really strict. So I had to remove some of the generated positions manually. I hope I did nothing wrong here. What remains is a list of 108 maneuvers, lexicographically sorted in the order U,R,F,D,L,B. Each of these maneuvers can be expanded to 48 different maneuvers by applying the 48 symmetries. So there should be 108*48 =5184 different canonical sequences which give superflip, considerably more than the 4416 of your estimation.
U R U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D R' L U2 F2 D2 F R2 D (20f*)
U R U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D B2 U2 F2 R' L F R2 D (20f*)
U R D2 R B2 L D2 R F' B' R2 U R' L D2 B2 U2 B R2 D (20f*)
U R D2 R B2 L D2 R F' B' R2 U F2 D2 B2 R' L B R2 D (20f*)
U R D2 F B D B2 D R2 U B2 D R' L' D2 F L2 B2 R2 D' (20f*)
U R D2 F' B' D L2 U F2 D L2 D R L D2 F R2 F2 L2 D' (20f*)
U R L U2 F U' D F2 R2 B2 L U2 F' B' U R2 D F2 U R2 (20f*)
U R L U2 F L2 F2 R2 U' D L U2 F' B' U R2 D F2 U R2 (20f*)
U R L U2 B U' D B2 L2 F2 R U2 F' B' U L2 D B2 U L2 (20f*)
U R L U2 B R2 B2 L2 U' D R U2 F' B' U L2 D B2 U L2 (20f*)
U R L' U2 B2 D2 F L2 U' D' L B2 R U2 L B2 L F B L2 (20f*)
U R L' D2 F2 U2 F L2 U D L D2 L F2 R D2 L F' B' L2 (20f*)
U R2 U R L U2 F U' D F2 R2 B2 L U2 F' B' U R2 D F2 (20f*)
U R2 U R L U2 F L2 F2 R2 U' D L U2 F' B' U R2 D F2 (20f*)
U R2 U B2 D R2 U F' B' U2 L U' D R2 B2 L2 B U2 R L (20f*)
U R2 U B2 D R2 U F' B' U2 L F2 R2 B2 U' D B U2 R L (20f*)
U R2 U2 L2 F' B R F2 U' D' F L2 B U2 F L2 F R L F2 (20f*)
U R2 F U2 F2 D2 R' L U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R D (20f*)
U R2 F R' L F2 D2 B2 U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R D (20f*)
U R2 F B R B2 R U2 L B2 R U' D' R2 F R' L B2 U2 F2 (20f*)
U R2 F B R B2 R U2 L B2 R U' D' R2 F D2 B2 U2 R' L (20f*)
U R2 F2 L2 F D2 R L D R2 D F2 U R2 D F' B' D2 L D' (20f*)
U R2 F2 L2 F' U2 R' L' U' R2 U' F2 D' R2 U' F B U2 L' D' (20f*)
U R2 F2 L2 B D2 R' L' D F2 U R2 D F2 D F B D2 R D' (20f*)
U R2 F2 L2 B' U2 R L U' F2 D' R2 U' F2 U' F' B' U2 R' D' (20f*)
U R2 F' U2 B2 D2 R L' D' R2 F' B' R' B2 R' D2 L' B2 R' D (20f*)
U R2 F' R L' B2 D2 F2 D' R2 F' B' R' B2 R' D2 L' B2 R' D (20f*)
U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R U D R2 F U2 F2 D2 R' L (20f*)
U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R U D R2 F R' L F2 D2 B2 (20f*)
U R2 D F2 U R2 U R L U2 F U' D F2 R2 B2 L U2 F' B' (20f*)
U R2 D F2 U R2 U R L U2 F L2 F2 R2 U' D L U2 F' B' (20f*)
U R2 D F2 U R' L' U2 B U' D F2 R2 B2 R U2 F B U F2 (20f*)
U R2 D F2 U R' L' U2 B L2 F2 R2 U' D R U2 F B U F2 (20f*)
U R2 D F2 D F B D2 R U D' R2 F2 L2 B D2 R' L' D F2 (20f*)
U R2 D F2 D F B D2 R B2 R2 F2 U D' B D2 R' L' D F2 (20f*)
U R2 D F' B' D2 L U D' R2 F2 L2 F D2 R L D R2 D F2 (20f*)
U R2 D F' B' D2 L B2 R2 F2 U D' F D2 R L D R2 D F2 (20f*)
U R2 D2 L2 F B' L B2 U D B D2 B L2 F D2 B R' L' B2 (20f*)
U R2 B R' L B2 U2 F2 D R2 F' B' R U2 L B2 R U2 R D (20f*)
U R2 B D2 B2 U2 R' L D R2 F' B' R U2 L B2 R U2 R D (20f*)
U R2 B' R L' F2 U2 B2 U' R2 F' B' R' F2 R' U2 L' F2 R' D (20f*)
U R2 B' D2 F2 U2 R L' U' R2 F' B' R' F2 R' U2 L' F2 R' D (20f*)
U R' U2 F B U' L2 D' F2 U' L2 U' R' L' U2 F' R2 F2 L2 D' (20f*)
U R' U2 F' B' U' B2 U' R2 D' B2 U' R L U2 F' L2 B2 R2 D' (20f*)
U R' F2 L' D2 R' F2 R' F' B' R2 D' R L' D2 F2 U2 B' R2 D (20f*)
U R' F2 L' D2 R' F2 R' F' B' R2 D' B2 D2 F2 R L' B' R2 D (20f*)
U R' L U2 F2 D2 B R2 U' D' R F2 L U2 R F2 R F B R2 (20f*)
U R' L D2 B2 U2 B R2 U D R D2 R B2 L D2 R F' B' R2 (20f*)
U R' L' U2 F U' D B2 L2 F2 L U2 F B U B2 U L2 D B2 (20f*)
U R' L' U2 F R2 B2 L2 U' D L U2 F B U B2 U L2 D B2 (20f*)
U R' L' U2 B U' D F2 R2 B2 R U2 F B U F2 U R2 D F2 (20f*)
U R' L' U2 B L2 F2 R2 U' D R U2 F B U F2 U R2 D F2 (20f*)
U R' B2 L' U2 R' B2 R' F' B' R2 U' R L' U2 B2 D2 F' R2 D (20f*)
U R' B2 L' U2 R' B2 R' F' B' R2 U' F2 U2 B2 R L' F' R2 D (20f*)
U D R U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D R' L U2 F2 D2 F R2 (20f*)
U D R U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D B2 U2 F2 R' L F R2 (20f*)
U D R2 F U2 F2 D2 R' L U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R (20f*)
U D R2 F R' L F2 D2 B2 U R2 F' B' R D2 L F2 R D2 R (20f*)
U D R2 F' U2 B2 D2 R L' D' R2 F' B' R' B2 R' D2 L' B2 R' (20f*)
U D R2 F' R L' B2 D2 F2 D' R2 F' B' R' B2 R' D2 L' B2 R' (20f*)
U D R' F2 L' D2 R' F2 R' F' B' R2 D' R L' D2 F2 U2 B' R2 (20f*)
U D R' F2 L' D2 R' F2 R' F' B' R2 D' B2 D2 F2 R L' B' R2 (20f*)
U D R' B2 L' U2 R' B2 R' F' B' R2 U' R L' U2 B2 D2 F' R2 (20f*)
U D R' B2 L' U2 R' B2 R' F' B' R2 U' F2 U2 B2 R L' F' R2 (20f*)
U D' R D2 F B D B2 D R2 U B2 D R' L' D2 F L2 B2 R2 (20f*)
U D' R D2 F' B' D L2 U F2 D L2 D R L D2 F R2 F2 L2 (20f*)
U D' R2 F2 L2 F D2 R L D R2 D F2 U R2 D F' B' D2 L (20f*)
U D' R2 F2 L2 B D2 R' L' D F2 U R2 D F2 D F B D2 R (20f*)
U2 R U D R2 B R' L B2 U2 F2 D R2 F' B' R U2 L B2 R (20f*)
U2 R U D R2 B D2 B2 U2 R' L D R2 F' B' R U2 L B2 R (20f*)
U2 R U' D R2 B2 L2 F U2 R' L' U B2 D R2 U B2 U F B (20f*)
U2 R U' D L2 F2 R2 F U2 R L U L2 U F2 D L2 U F' B' (20f*)
U2 R F2 U D F D2 F R2 B D2 F R' L' F2 U F' B D2 R2 (20f*)
U2 R F2 R F B R2 U R' L U2 F2 D2 B R2 U' D' R F2 L (20f*)
U2 R F2 R F B R2 U B2 U2 F2 R' L B R2 U' D' R F2 L (20f*)
U2 R F2 R2 B2 U' D F U2 R' L' U B2 D R2 U B2 U F B (20f*)
U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D R' L U2 F2 D2 F R2 U D R (20f*)
U2 R F2 L U2 R F' B' R2 D B2 U2 F2 R' L F R2 U D R (20f*)
U2 R F2 L U2 L U D L2 F R L' F2 U2 B2 D L2 F' B' L (20f*)
U2 R F2 L U2 L U D L2 F D2 F2 U2 R L' D L2 F' B' L (20f*)
U2 R F2 L U' D' L2 B R L' F2 U2 B2 U L2 F B L F2 L (20f*)
U2 R F2 L U' D' L2 B D2 F2 U2 R L' U L2 F B L F2 L (20f*)
U2 R F' B' R2 D R' L U2 F2 D2 F R2 U D R U2 R F2 L (20f*)
U2 R F' B' R2 D B2 U2 F2 R' L F R2 U D R U2 R F2 L (20f*)
U2 R L U R2 U B2 D R2 U F' B' U2 L U' D R2 B2 L2 B (20f*)
U2 R L U R2 U B2 D R2 U F' B' U2 L F2 R2 B2 U' D B (20f*)
U2 R L U L2 U F2 D L2 U F' B' U2 R U' D L2 F2 R2 F (20f*)
U2 R L U L2 U F2 D L2 U F' B' U2 R B2 L2 F2 U' D F (20f*)
U2 R L U' F2 D' R2 U' F2 U' F' B' U2 R' U D' R2 F2 L2 B' (20f*)
U2 R L U' F2 D' R2 U' F2 U' F' B' U2 R' B2 R2 F2 U D' B' (20f*)
U2 R L U' B2 D' L2 U' B2 U' F' B' U2 L' U D' L2 B2 R2 F' (20f*)
U2 R L U' B2 D' L2 U' B2 U' F' B' U2 L' F2 L2 B2 U D' F' (20f*)
U2 R L' U L2 F B L F2 L U2 R F2 L U' D' L2 B D2 F2 (20f*)
U2 R L' U' R2 F' B' R' F2 R' U2 L' F2 R' U D R2 B' D2 F2 (20f*)
U2 R L' D L2 F' B' L U2 R F2 L U2 L U D L2 F D2 F2 (20f*)
U2 R L' D' R2 F B R' U2 L' F2 R' U2 R' U' D' R2 F' D2 F2 (20f*)
U2 R B2 U' D' B L2 F D2 B L2 B R L B2 D F B' D2 L2 (20f*)
U2 R B2 L2 F2 U' D F U2 R L U L2 U F2 D L2 U F' B' (20f*)
U2 R2 U B2 R L B L2 B U2 F L2 B U' D' B2 R F B' L2 (20f*)
U2 R2 F B' R B2 U D B U2 B R2 F U2 B R' L' B2 D L2 (20f*)
U2 R2 F B' R' F2 U' D' F' U2 F' R2 B' U2 F' R L F2 D' L2 (20f*)
U2 R2 F B' L B2 U' D' B R2 F U2 B R2 B R L B2 U L2 (20f*)
U2 R2 F B' L' F2 U D F' R2 B' U2 F' R2 F' R' L' F2 U' L2 (20f*)
U2 R2 D B2 R' L' B U2 F L2 B U2 B U D B2 L F B' L2 (20f*)
U2 R2 D2 R B2 U D B U2 B R2 F U2 B R' L' B2 D F B' (20f*)
U2 R2 D2 F B' U B2 R' L' B D2 F R2 B D2 B U D B2 R (20f*)
U2 R2 D2 F B' D B2 R L B R2 B D2 F R2 B U' D' B2 L (20f*)
U2 R2 D2 L B2 U' D' B R2 F U2 B R2 B R L B2 U F B' (20f*)